上海市农业科学院是上海市人民政府直属的综合性农业科研机构，成立于1960年。下设10个研究机构，拥有6个国家级技术平台、2个市级重点实验室和一批科技公共服务平台。

    全院现有在职职工980名，其中专业技术人员520人，高级专业技术职务科技人员187名，硕、博士227名，国务院特殊津贴专家66名。形成了优质粮油种质创新,设施园艺技术,农业生态技术,农产品质量安全检测技术,食药用菌品种选育与栽培,都市型农业理论研究六大领域,正在发展建设农业生物技术,农业信息技术,农产品保鲜加工,林木花卉引选四大新兴学科和农业生态环境的检测与评价,动植物病虫,疫病防治及预警体系研究,农业生物资源的收集,评价和创新三大基础学科（领域）。与30多个国家或地区开展科技交流和合作研究。编辑出版《上海农业学报》和《食用菌》等7种学术类、技术类刊物，重点培育生物疫苗、食（药）用菌、种子种苗三大科技产业，科技服务立足上海、辐射长三角，服务全国“三农”。

吴爱忠  现任上海市农业科学院党委书记、院长， 上海交通大学教授、博士生导师 。

    “十五”以来，紧紧围绕市委、市府提出的实施科教兴市战略和建设农业科技强市以及高效、生态现代农业的目标，坚持自主创新，加强学科、平台、基地和队伍建设，不断提升科技创新能力和自我发展能力。全院共承担国家、部（市）级以上科研攻关项目453项，获得部（市）级以上科技成果奖59项，其中，市科技进步一等奖8项，130个农作物新品种通过审（认）定。

    面对新形势，坚持“科技立院、开发兴院、人才强院、开放办院”的治院方针，力争到2010年基本建成国内一流、国际有影响的具有都市型农业特色的现代农业科学院和区域性的都市型农业科研中心，成为农业科技创新基地、科技成果转化展示基地、人才培养基地和国际农业科技合作交流基地，为上海率先基本实现农业现代化、建设社会主义新农村提供支撑。